院徽整体为圆形，由绿、白、蓝三种颜色构成。中心图案中蛇杖采用绿色，寓意为生命之树常青；白色衬底象征着白衣天使纯洁的心灵；蓝色代表蓝天和海洋，象征着医护人员拥有比天宽、比海阔的胸襟。整个图案的用色象征在同一片蓝天下，白衣天使用爱心护佑着人类的生命与健康。院徽图案主要结构由两个同心圆构成，表示医患双方心心相印。中心图案由蛇杖和艺术化的湘雅（XiangYa）英文的第一个字母“x”“y”组合而成。蛇杖是国际公认的医学标志，同时图案中的蛇酷似字母“S”，是Stomatology(口腔医学）的缩写。整个中心图案代表“大湘雅中的口腔医学”。中心图案下方的数字“1986”，是湘雅口腔医学建系的时间。外环上的中英文与汉字，展示了中西合璧、西为中用的发展历程，并时刻告诫湘雅口腔人把握机遇，注重交流，寻求发展，为建设湘雅口腔美好的明天而贡献自己的力量。
